病例介绍：62岁男患，既往高血压病史多年。诊断：左侧基底节脑出血破入脑室，高血压病3级（极高危组），发病25小时行钻孔引流手术。
分类目录归档：未分类
Slicer materials from the WeChat Slicer group in China.
There’s a great set of materials from the WeChat Slicer group in China.Clinical Imaging Practice Website and Slicer Chinese Discourse Tutorials are continually being updated.The following article is part of that.
List of WeChat Tutorial Articles
01.Cerebral hemorrhage location post location zero basic series tutorial. Original in Chinese
02.Surgical localization of cerebral hemorrhage. Original in Chinese
| Serial Number | Article Title | Author |
| 01 | Transurethral hemorrhage surgical localization (1) | Cao Yufu |
| 02 | Transurethral hemorrhage surgical localization (II) | Ho Guitong |
| 03 | Cerebral hemorrhage transurethral surgical localization method (3) | Yu Dejun |
| 04 | Cerebral hemorrhage transurethral surgical localization method (IV) | Sun Zong-han |
| 05 | Cerebral hemorrhage transurethral surgical localization method (5) | Cao Yufu |
| 06 | Coordinate positioning method for transtemporal hematoma puncture | Wuyang |
| 07 | Intracranial lesion body surface localization | Xu-Jun Sohn |
| 08 | How to use GyroGuide | Sun Wook-jun |
| 09 | Image J in brain hemorrhage puncture localization | Sun Zong-han |
| 10 | 3 minutes to locate brain hemorrhage | Cao Yufu |
03.Neurosurgical Planning Tutorial for Cerebral hemorrhage, intracranial hematoma surgery. Original in Chinese
04.Diffusion Tensor Imaging Easy Tutorial. Original in Chinese
| Serial Number | Article Title | Author |
| 01 | DTI Tutorial 01-DTI Introduction and Software Installation | Cao Yufu |
| 02 | DTI Tutorial 02 – Data Conversion Primer | Cao Yufu |
| 03 | DTI Tutorial 03 – Data Conversion Intermediate | Cao Yufu |
| 04 | DTI Tutorial 04 – Advanced Data Conversion | Cao Yufu |
| 05 | DTI Tutorial 05-DWI Data Loading | Cao Yufu |
| 06 | DTI Tutorial 06 – Brain Mask | Cao Yufu |
| 07 | DTI Tutorial 07 – Calculating Dispersion Tensor | Cao Yufu |
| 08 | DTI Tutorial 08-Fa graphs and scalar measurements | Cao Yufu |
| 09 | DTI Tutorial 09 – Visualization of the Dispersion Tensor | Cao Yufu |
| 10 | DTI Tutorial 10 – Brain Fibroid Imaging | Cao Yufu |
| 11 | DTI Tutorial 11-Callosal Fibroblast Imaging | Cao Yufu |
| 12 | DTI Tutorial 12 – Parameter Adjustment for Fiber Bundle Imaging | Cao Yufu |
| 13 | DTI Tutorial 13 – Corticospinal Tract Fibroscopy | Cao Yufu |
| 14 | Fiber bundle reconstruction and export in OBJ&STL format | Xuk-joon |
05.Neurosurgical Planning for surgery of intracranial tumor. Original in Chinese
| Serial Number | Article Title | Author |
| 01 | 3DSlicer Localization of Brain Tumors | Cao Yufu |
| 02 | 3DSlicer protocol for skull resection phase 1 repair in meningioma patients | Ho Guitong |
| 03 | The superficial tumor localization in Slicer | Ho Guitong |
| 04 | Application of 3D Slicer 3D reconstruction technique in cerebral cortex tumor resection | Ho Guitong |
| 05 | 3D Slicer Clinical Application of Sinus Parietal Meningioma | Hen-Hao Fok |
| 06 | 3Dslicer simulation of surgical access to CPA tumor | Pang Yat-lung |
| 07 | 3D Slicer-assisted intracranial tumor surgery design example | ZHOU Xiang |
| 08 | 3DSlicer multimodal fusion-assisted meningioma resection 1 case | Zhao Peng |
| 09 | 3DSlicer Real-Time Tumor Localization of Superficial Tumors | Ho Guitong |
06.Neurosurgery planning for surgery of Intracranial aneurysm, cavernous hemangioma, AVM. Original in Chinese
07.Localization of intracranial lesions. Original in Chinese
08.Image Registration & Multimodal fusion. Original in Chinese
| Serial Number | Article Title | Author |
| 01 | Slicer (Elastix or BRAINS) Calibration for DTI Calibration | DOCHANGWANG |
| 02 | SPM Joint Slicer (BRAINS or Elastix) Notification for DTI Notification | CHANGWANG TO |
| 03 | Building the foundation of multimodal imaging – SPM calibration | Du Changwang |
| 04 | 3D Slicer Tutorial on Data Matching (I) | Ho Guitong |
| 05 | 3D Slicer Tutorial on Data Matching (2) | Ho Guitong |
| 06 | Fusion of images of different examination sites using 3D Slicer | Wang Kui Chung |
| 07 | 3Dslicer’s ROI-based method for accurate matching of CT data across time | Zhang Guangzhu |
| 08 | Individual resolution of image sequences required for tumor multimodality | Qiu Jun |
09.Slicer for anatomical learning. Original in Chinese
| Serial Number | Article Title | Author |
| 01 | Ventricular Systematic Dissection (I) | Cao Yufu |
| 02 | Ventricular System Anatomy (2) | Cao Yufu |
| 03 | Learning cranial dissection with 3DSlicer | Cao Yufu |
| 04 | Summary of anatomical CT images of the nasal cavity, sinuses and cranial floor | SHU Xujun |
| 05 | Application of CTVE technology based on 3DSlicer to the three-dimensional anatomy of the nasal butterfly sinus | Xu-Jun Sun |
| 06 | Transnasal virtual endoscopy reveals saddle bottom anatomy (video) | SHUYUKJUN |
| 07 | 3DSlicer – too pretty to be a powerhouse | Sun Wook-jun |
| 08 | A Sneak Peek at 4D image | Sou Wook-jun |
10.Segmentation for 3D printing. Original in Chinese
| Serial Number | Article Title | Author |
| 01 | How to use 3D Slicer to implement model 3D printing | Sun Xuk-jun |
| 02 | Design of 3D printed puncture guide plate | YANG Lizhi |
| 03 | 3D printing of puncture navigation tube module using 3D Slicer software | Zhao DuanYun |
| 04 | 3D image of a case of pulmonary artery embolism | Li Dongqun |
11 3D tutorial for removing the backplane Original in Chinese
| Serial Number | Article Title | Author |
| 01 | 3DSlicer Tutorial on Removing the Backplane(1) | Cao Yufu |
| 02 | 3DSlicer Tutorial on Removing the Backplane (2) | Cao Yufu |
| 03 | 3DSlicer Tutorial on Removing the Backplane (3) | Cao Yufu |
| 04 | 3DSlicer Tutorial on Removing the Backplane (4) | Cao Yufu |
| 05 | 3DSlicer Tutorial on Removing the Backplane (5) | Cao Yufu |
| 06 | The ultimate law of CT de-backsplating | Cao Yufu |
12.Hematoma segmentation tutorial. Original in Chinese
| Serial Number | Article Title | Author |
| 01 | 3DSlicer Tutorial Hematoma Modeling (01) | Cao Yufu |
| 02 | 3DSlicer Tutorial Hematoma Modeling (02) | Cao Yufu |
| 03 | 3DSlicer Tutorial Hematoma Modeling (03) | Cao Yufu |
| 04 | 3DSlicer Tutorial Hematoma Modeling (04) | Cao Yufu |
| 05 | 3DSlicer Tutorial on Hematoma Modeling (05) | Cao Yufu |
| 06 | 3DSlicer Tutorial on Hematoma Modeling (06) | Cao Yufu |
| 07 | 3DSlicer Tutorial Hematoma Modeling (07) | Cao Yufu |
| 08 | 3DSlicer Tutorial Hematoma Modeling (08) | Cao Yufu |
| 09 | 3DSlicer Tutorial on Hematoma Modeling (09) | Cao Yufu |
| 10 | 3DSlicer Tutorial on Hematoma Modeling (10) | Cao Yufu |
| 11 | 3DSlicer Tutorial Hematoma Modeling (11) | Cao Yufu |
13.Segment cerebral vasculature. Original in Chinese
| Serial Number | Article Title | Author |
| 01 | 3DSlicer Tutorial of CTA(01) | Cao Yufu |
| 02 | 3DSlicer Tutorial of CTA(02) | Cao Yufu |
| 03 | 3DSlicer Tutorial of CTA(03) | Cao Yufu |
| 04 | 3DSlicer Tutorial of CTA(04) | Cao Yufu |
| 05 | 3DSlicer Tutorial of CTA(05) | Cao Yufu |
| 06 | 3DSlicer Tutorial of CTA(06) | Cao Yufu |
| 07 | 3DSlicer Tutorial of CTA(07) | Cao Yufu |
| 08 | CTA Tutorial on Digital Subtraction | Cao Yufu |
14.Slicer clinical application. Original in Chinese
| Serial Number | Article Title | Author |
| 01 | 3 cases of unusual “scalp swelling” | Hok Kwai Tung |
| 02 | Facial muscle spasm (HFS)& Microvascular decompression (MVD) | Wang Wenxin |
| 03 | 3D Slicer in renal tumors | Zhao Wei |
| 04 | hepatic cystic lesion puncture drainage | Gao Yuan Yuan |
| 05 | 3D Slicer simulation of repaired skulls that are more symmetrical than naturally growing | Wang Kui-hei |
15.Slicer tutorial. Original in Chinese
16.Machine learning, Povision 3D. Original in Chinese
| Serial Number | Article Title | Author |
| 01 | Machine Learning in Slicer (1) | Sun Xuk-jun |
| 02 | Application of Machine Learning in Slicer (2) | Xuk-Joon Sohn |
| 03 | Application of Machine Learning in Slicer (3) | Xuk-Joon Sohn |
| 04 | Talking about “data sharing and blockchain technology” | Sun Xujun |
| 05 | Povision 3D to 3D image “empowerment” | XuJun |
17.slicer Chinese version released. Original in Chinese
| Serial Number | Article Title | Author |
| 01 | Slicer Chinese version released | Cao Yufu |
| 02 | Slicer community says hello to everyone | Sum Xuk-jun |
| 03 | 2019 is over, I hope I can live up to my years | Shaun Wuk Chun |
Clinical Imaging Practice Website and Slicer Chinese Discourse Tutorials are continually being updated.This article above is part of that.
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Slicer+AR：人人都能做的AR
上一篇我们体验了SlicerVR，由于受设备限制，很多人无法体验VR带来的沉浸感。这次我们带来了AR，只要有一台装win10系统并带摄像头的PC就可以，我相信大部分人都可以体验AR带来的乐趣。
AR在医疗方面越来越受到大家的关注，临床应用AR的新闻报道也屡见不鲜。
但由于技术门槛过高，专业AR设备昂贵，导致大多数人只能袖手旁观。网上有很多AR开发的教程、论坛及网络课程，但是作为零基础的门外汉，入门十分困难，就算坚持学习，遇到问题也无人能帮助解答，而那些懂技术的大佬，他们在自己的世界里忙着嗨，根本无暇顾及我们这些门外汉。
3DSlicer社区作为一个良心公众号，除了推广slicer，发布教程，还不断尝试探索AR和VR等新技术在临床中的使用价值。目前已经有很多人能熟练掌握3DSlicer，并在临床和科研中应用它。Slicer项目的官方负责人之一Steve Pieper也说：每次看SlicerCN都会有惊喜，他们做得很棒。这其中有我们无私的、辛劳的付出，也有大家的积极参与和支持。
言归正传，知识需要分享才有价值。今天教大家用Slicer来定制一个“颅骨AR影像”，当然你也可以做成血管或者其他任何你想的东西，并将它显示在我们的书桌上，跟着教程一步一步做，零基础也能成功，先看一下大致效果
第一步：将颅脑CT的dicom数据导入Slicer，再在Segment Editor中用阈值分离出颅骨，并在三维视窗中显示
第二步：导出颅骨模型。点击segmentation后面的小三角，选择export to files，弹出对话框，第一行是模型的保存路径，你可以更改；下面是模型格式，可以选stl，也可以选obj；坐标系统选择LPS，最后点击Export。
在指定路径中找到我们导出的颅骨stl文件
第三步：启动Windows10系统自带的3D Viewer软件。如果你的系统没有，可以在Microsoft store中下载
3D Viewer启动后的界面
第四步：载入模型。直接将颅骨stl文件拽入3D Viewer软件，载入需要一段时间
等待颅骨模型载入成功。如果你的模型是倒着的，请回到slicer，导出文件时选择RAS坐标系，重新导出模型。
第五步：点击右上角混合现实开关，开启AR模式
点击桌面，放置颅骨，目前只支持水平面放置，不支持垂直平面放置。
可以用鼠标移动、旋转模型
还有一些其他功能，大家自己尝试
我用的是USB外接摄像头，所以镜头可以移动，笔记本可以用自带的前置摄像头，只是观看起来会麻烦一点。
切换前置摄像头，将笔记本盖下合一些，能将模型放置在前面的桌面上
最后，有人要问，为什么没有颜色？因为我们只是载入了模型，并没有将材质信息载入3DViewer，添加颜色要借助于其他三维软件来实现，这里不作讲解。如果你有好方法，欢迎文末留言分享。
这是目前硬件要求最低、制作最简易，并能和slicer对接的AR制作方法。希望此教程抛砖引玉，对需要的人有所帮助！
原文请参阅公众号slicercn：
Slicer+AR：人人都能做的AR
漫谈空间维度与信息
今天和大家聊一个有趣的话题：空间维度和信息！
中国科幻作家刘慈欣在科幻小说《三体》中首次提出了“降维打击”的概念，它是指通过使用一种特定的武器，使某一多维空间的其中一个维度无限蜷缩，比如三维空间失去一个维度后，降为二维空间，所有的物质向二维宇宙坍塌，最终溶解成只存在长和宽但高度被剥夺的绝对平面中。也就是说一切在一瞬间都被拍扁平了。可见，高维对低维的打击是毁灭性的，超乎想象的。
高维对于低维拥有绝对的优势。在一只毛毛虫的大脑中，世界是二维平面的，只有“前后”、“左右”两个维度，没有“上下”这第三个维度，所以，当它被一根从天而降的手指碾死时，一定死不瞑目。那么身处三维世界的我们，同样无法想象有“人”从第四个维度忽然出现……
这种高维优势也体现在我们对事物的认知上。从一维、二维到三维，可以发现：（1）信息随着维度的增加而增加，维度越高，你获得的信息越多；（2）每个维度内的信息是有限的，量变不会引起信息的质变，比如上图中的两个毛毛虫不管他们如何观察对方，都只能获取它所观察对象前、后、左、右的信息；（3）高维信息低维无法获取，两只毛毛虫在二维平面内是永远无法获取他们“背部和腹部”信息的。所以说，维度越高，观察者获得信息越多，距离认识事物的本质就越近。
但是当我们拥有同一事物多层低维信息时，我们可以通过想象和推理来反映该事物高一级维度的信息。打个比方：如果只有一张人脑的CT断层图像，我们只能知道脑室在该平面的形态，根本无法知晓它的三维形态。
当有脑室不同层面的二维影像时，我们可以通过思维能力在大脑中创造出脑室的三维形态。这就是不同层面的二维信息堆叠可以反映三维信息，这也证明了人类大脑的思维能力是何等强大。
这种二维平面医学影像仍是当今临床使用最广泛的信息载体。读懂CT、MRI、超声等影像需要医生接受专门的训练和学习，通过几年甚至几十年的训练和学习，当医生看到这些平面影像时，能够在脑海中形成立体影像，甚至捕捉到影像上没有的信息。
但令人遗憾的是，就算是经验丰富专家也无法完全在大脑中完全还原影像上的细节。我们在脑海中重建的立体形态，尤如画家画板上的屋舍、树木、牛、马一样，虽然有形，却无法测量，客观反映实体的信息。也就是说，很难想象迂曲走行地血管、肿瘤的立体形态，更难以计算病变的体积。比如有学者指出：多田公式并不能准确估算血肿的体积。
再比如：有A、B两个人，桌上有一张CT，是他们其中之一的，仅通过阅片，你能判断CT是哪个人的嘛？换个简单点的说法就是：你能通过阅览CT想象出被扫描者的容貌嘛？
对于这个问题，有人觉得没有任何意义；也有人觉得不可能。
萧伯纳曾有一言：有些人只看事物的表面，他们问Why？而我却想象事物从未呈现的一面，我问Why not？
问“why”能加深对某个领域的理解，而问“why not”则能推动这个领域发展。
当我们用slicer将二维影像转换成三维影像时，这个看似不可能的问题，变得如此清晰和直观，你可以看到患者脸上褶皱，甚至他扫描时的表情。
这有点让人细思极恐。因为，我们经过多年专业培训才能看懂的影像，现在转化成三维影像后，就算毫无医学知识背景的人也能很容易辨认：哦~绿色的是肿瘤吧，它原来是这个样子，它和黄色的神经紧紧挨着，周围有红色的血管经过，手术的难点在于肿瘤切到最后保护好神经以及不破坏血管吧！
多年来，我们一直提倡个体化治疗，但进展缓慢。个体化治疗的前提就是尽可能多地得到个体化的信息，而个体化影像是个体化治疗的重要因素。所以，三维影像不仅符合大数据时代的要求，还会促进个体化治疗发展。毕竟，在三维的尺度上，细节是那么地清晰和直观。
当然，维度越高所获得的信息就越多。但超过三维的高维空间，是我们难以理解地，它们只是数学中的概念。不过，闵科夫斯基时空算是最接近我们现实世界，也是我们最容易理解的，那就是在三维时空里加上一条单向时间轴，构成一个四维时空。
四维影像会是怎么样的？第一时间我能想到是以下的场景。
同样，当我们把不同时间节点的心脏CTA数据载入slicer后，可以看到得是一个活动的心脏（Beating Heart）：心肌的收缩，冠脉的舒张，主动脉的搏动……
是的，以往没有任何影像能如此生动地展示活体器官在体内的真实运动。
四维影像包含事物生长、演化直到死亡的全过程，它几乎拥有事物全部的影像信息。四维影像已经可以实现，当我们看肿瘤、脑积水、血管畸形等病变的四维影像时……那一时刻足以令人震撼，也令人敬畏！站在四维高度审视它们时，犹如拥有上帝视角，它们在时间序列上的演化将为我们提供难以想象的细节。那么，我们更接近理解生命的本质了嘛？
这里不妨思考一个问题：我们现有的医学知识体系是对生命的正确描述呢？还是我们创造了一个知识体系是为了能很好的理解生命？也许后者更合理。那么又会引出一个新问题：这个知识体系对生命未知部分仍然有效嘛？
科学并不等于真理，它只是人类迄今为止找到的最可靠的逼近真理的方法！
OK！言归正传，以上全是扯淡！其实我想说得是：3D Slicer 很强大！还不要钱！你值得拥有！SlicerCN是国内最大的slicer论坛，你还不关注一下嘛？！！
文中观点属于作者本人，如有错误归于作者，与本公众号无关！
原文请参阅：
漫谈空间维度与信息
肝囊性病变穿刺引流
作者：高圆圆
编辑：束旭俊 解放军第82医院
审校：曹玉福 鹤岗市人民医院神经外科
声明：文章所有权归属作者，如需转载或引用图文请联系作者并注明出处。更多3DSlicer教程请关注公众号：SlicerCN（3DSlicer社区），问题交流及答疑请关注论坛：https://forum.slicercn.com，需要邮箱进行注册并验证。入群交流请加微信好友：caoyufu。
一、简介
肝脏囊性疾病是临床十分常见的肝内占位性病变，其病理分型复杂，可分为囊肿及囊性肿瘤，而以囊肿为主，其中绝大多数为单纯性囊肿，占98%以上。过去囊肿开窗引流术是标准的治疗方法。但囊肿引流术出现后，外科手术逐渐被这种创伤小且疗效明显的方法所替代。
二、影像报告
肝脏体积增大。肝右叶见巨大囊性占位性病变，病灶边界较清。密度较均匀，动态增强扫描病灶未见强化，边缘见点状钙化影，门静脉右支未见显示，肝右静脉，下腔静脉肝内段及右肾上极受压，移位。
三、三维影像
1、治疗前（2017年12月7日）
2、囊肿引流术后(2017年12月18日)
3、囊肿引流术后(2018年1月8日)
四、治疗效果
更多内容请参阅微信公众号文章：
肝囊性病变穿刺引流
一招鉴别动脉瘤还是动脉壶腹样扩张
是 动 脉 瘤 吗 ？
做了CTA或者MRA检查发现颅内“动脉瘤”，有的医生建议进一步做脑血管造影检查（是一种有风险的检查，费用大概4000元左右），甚至有的医生建议手术治疗。其实这里面有一部分不是真正的动脉瘤，而是动脉起始处的壶腹样扩张，动脉瘤是一种疾病，往往需要治疗，而壶腹样扩张是生理变异，是不需要治疗的，动态观察即可。
以下情节纯属虚构
家属拿着CTA片来就诊，CTA报告单：颈内动脉后交通段的小凸起，考虑动脉瘤，建议进一步检查。
有经验的医生不难看出，CTA所见凸起的部位恰巧是颈内动脉发出后交通动脉的位置，而后交通动脉没有显示，不能确诊为动脉瘤，当然仅根据CT片也不能排除动脉瘤。
那到底是不是动脉瘤啊？怎么才能确诊啊？
CTA对人体的损害主要是放射线的损害和造影剂对肾脏的损害，一般情况下如果肾功能化验正常，出现肾脏损害的几率非常小。如果肾脏功能有严重异常，不适合行CTA检查的，可以考虑行MRA（核磁血管成像）检查，不过假阳性率会很高，但不用打造影剂，是无创检查，特别适合健康体检人群。
必须做DSA吗，如果是2年前，我的答案是应该做。但是现在情况不一样了，再遇到此类患者，90%的情况下不需要再行DSA检查了。
因为2016年末我遇到了3DSlicer……（此处省略3千字，详情参见文末阅读原文）
您只需求助CT室工作人员，刻一张CTA的DICOM数据光盘，再打开3DSlicer软件即可，刻盘工本费必不可少，CT机器配的刻录机可不是普通市面销售的几百元产品，标配的刻录机损坏维修就要千元不止。
应用3D Slicer软件可以了解下列信息：
CTA显示主动脉弓情况（已经过3DSlicer软件的精细处理）。
还可以了解颅内血管的结构，包括一些细节情况。
也可以了解静脉窦的情况（因机器而异）。
还可以对血管进行建模操作，用于3D打印。
还可进行手术预案，了解动脉瘤的大小、形态、周围血管颅骨关系，模拟手术入路及夹闭情况。
今天要了解的是颈内动脉的小凸起，到底是不是动脉瘤。
双侧颈内动脉后交通段都有小凸起。
看着还真挺像动脉瘤。
只需一步，即可验证，进入到Volume Rendering模块，调节Shift滑块可以查看之前未显影的血管及更多细节。
在三维视窗中显示如下，后交通动脉由无到有的显示是不是很神奇。
说明：除了后交通动脉显影，一些“杂质”也会同时显影，干扰观察，需要借助ROI只观察后交通动脉起始处。此例便于大家理解已经去除了“杂质”的显影。
原来是后交通动脉的壶腹样扩张！！！是不需要治疗的，由于后交通动脉壶腹是动脉瘤的最好发部位，所以定期复查还是有必要的。
另一个小凸起也是后交通动脉的壶腹样扩张，靠近远心端的小凸起为脉络膜前动脉发出处。
说明：目前DSA检查仍是诊断动脉瘤的金标准，CTA无法明确的时候仍需要进行DSA检查，尤其是需要了解血液动力学情况的时候。
下面是广告时间：
3D Slicer是医学图像处理软件，免费下载，免费学习。教程请关注公众号：3DSlicer中国社区（SlicerCN）目前已经有5000多人关注，网站 www.slicercn.com用邮箱注册并经过验证后，可以在论坛 forum.slicercn.com发帖提问。可加微信好友（caoyufu）入群交流。黑龙江鹤岗市的朋友看片可以到鹤岗市人民医院神经外科三病房（B栋5楼）找曹玉福主任阅片，提3DSlicer社区看到的信息，免阅片费（省内某公司收费3000元）。
点击下方公众号链接可了解3DSlicer的详细信息。
一招鉴别动脉瘤还是动脉壶腹样扩张
面肌痉挛（HFS）& 显微血管减压术（MVD）
作者：王文鑫 解放军301医院神经外科
术者：崔志强 解放军301医院神经外科
编辑：束旭俊 解放军 82 医院神经外科
审校：曹玉福 鹤岗市人民医院神经外科
文章所有权归属作者，如需转载或引用图文请联系作者并注明出处。更多3DSlicer教程请关注公众号：SlicerCN（3DSlicer社区），问题交流及答疑请关注论坛：https://forum.slicercn.com，需要邮箱进行注册并验证。
面肌痉挛（Hemifacial Spasm）是一侧面部肌肉不自主地阵发性抽搐，俗称“面抽”。和三叉神经痛、舌咽神经痛一样，原发性面肌痉挛的病因是脑干部位血管搏动性压迫神经根出脑干区域（Root Exit Zone，REZ），导致神经脱髓鞘而发生短路。按此理论逻辑，最直接的治疗方式就是显微血管减压手术（Micro-Vascular Decompression，MVD）。
MVD因翻译问题，国内普遍存在“微血管减压术”和“显微血管减压术”两种叫法，虽一字之差，但意义却截然不同，前者虽更符合直译，但却让人认为压迫神经的责任血管是微血管，这显然与实际不符；后者强调的是显微技术下解除责任血管压迫，更贴合实际。
现代医学影像能在术前判断是否有血管压迫。约95%的患者可在术前MRI上看到责任血管异常走行压迫神经。3D TOF序列能看清血管走行，高分辨T2序列（GE叫CISS序列、飞利浦叫DRIVE序列）能看到神经在桥前池内走行，两者联合起来，可以判定血管和神经的关系，对于诊断及术前计划十分有价值。
TOF序列可以清楚地看到血管走形
CISS序列可以看到桥前池内细小的神经、血管走形，但神经、血管均为低信号不易识别，需与TOF序列互补。
需要注意的是，以上影像检查仍会出现一小部分假阴性或假阳性的病例。我们利用3D Slicer将影像三维化重建，能够得到更多血管走形及神经的细节，看是否有助于减少假阴性的概率。
我们之前也用Slicer展示过血管压迫神经的三维成像方法：利用TOF序列重建血管+CISS序列重建颅内神经+T1序列重建脑干。这种方法能够很形象地看到血管和神经的关系。
在此三维影像的基础上还可以进行虚拟手术演示
但是在实际应用中会经常会发现因血管太细小无法重建的问题，这可能也是造成假阴性的结果。下图可见基底动脉与面听神经毗邻，仔细观察，也可以看到微小血管与神经关系更加密切，但其走形无法三维显示。所以，责任血管到底是那个，术前影像很难断定。
尝试对面听神经周围的微小血管进行分割重建，淡蓝色是微小血管，黄色是面听神经，绿色是脑干部分。
对微小血管分割（segment）之后，三维重建显示效果并不好，因血管太细，走形基本无法显示
要想得到更多的解剖细节，需要改变三维成像方式，Volume Rendering成像能保留更多的细节，同时还便于动态调整，是血管三维成像的首选。
用Volume Rendering对TOF进行血管成像，可见基地动脉虽然走形异常弯曲，但和右侧面听神经之间还是有一些空间，并未见直接压迫。
调节Volume Rendering的阈值，使其显示小血管，调低阈值虽然会增加背景杂质，但是能清楚显示小血管的走形，下图可见一条血管位于基底动脉右侧，径直向下走形，与面神经相邻，该血管为小脑前下动脉（AICA），而位于左侧椎动脉上有个壶腹突起，应该是小脑后下动脉（PICA）的起始部。
用Volume Rendering方式来显示血管能展示更多细节，也有助于对责任血管的判断，下图是术中所见，面神经内侧有一条小血管相邻，与三维影像显示一致，可判定为AICA。
轻轻拨开面神经，可见AICA位于神经和基底动脉之间。
进一步分离AICA，可见AICA在面听神经出脑干部位形成一个血管襻（下图黑圈部位）。
剥离子轻轻牵开AICA，血管襻可以看得更清楚。
该病例责任血管术中证实为AICA，与术前三维影像所见基本一致。本例难度在于AICA在TOF上显示太细小，很难观察到，单从水平切片视图上看，因椎-基底动脉向右侧迂曲走形，很容易误判为责任动脉。同样，用Segment的方法来做三维影像也无法显示AICA，只有Volume Rendering三维成像，调节Shift值才可见。所以我们推荐使用Volume Rendering来做血管三维成像，具体操作方法见下方视频教程。
更多解剖相关文章：
脑室系统解剖（二）
作者：曹玉福 鹤岗市人民医院神经外科
声明：文章所有权归属作者，如需转载或引用图文请联系作者并注明出处。问题交流及答疑请关注论坛：https://forum.slicercn.com，需要邮箱进行注册并验证。入群交流请加微信好友：caoyufu。
脑室外引流（EVD）是神经外科医师需要掌握的一项最基本的操作技能。初学者除了应该遵守一定的技术操作规范，还应该熟悉相关解剖知识。以下部分图片及视频来源于网络，如有侵权请告知做删除处理。
VR脑室展示方法参见脑室系统解剖（一），文末附链接。
脑室系统：是位于脑内的腔隙，包括侧脑室、第三脑室、第四脑室及连结它们的孔道。
中英对照：
① Lateral ventricles：侧脑室
② Interventricular foramen：室间孔
③ Interthalamic adhesion：中间块
④ Cerebral aqueduct：中脑导水管
⑤ Third ventricle：第三脑室
⑥ Fourth ventricle：第四脑室
⑦ Central canal：（脊髓）中央管
将轴位扫描的薄层MRI数据输入到3DSlicer中，矢状位及冠状位自动重建，通过调整层面的对应关系，方便对解剖结构的学习。
中英对照：
① Head caudate nucleus：尾状核头
② Corpus callosum：胼胝体
③ Septum pellucidum：透明隔
中英对照：
① Corpus callosum：胼胝体
② Fornices（body）：穹窿体
③ Thalamus：丘脑
④ Hypothalamus：下丘脑
⑤ Choroid plexus：脉络丛
中英对照：
① Tail caudate nucleus：尾状核尾
② Tapetum：毯
③ Hippocampus：海马
④ Hypothalamus：下丘脑
⑤ Third ventricle：三脑室
中英对照：
① Tapetum：毯
② Calcar avis：禽距
③ Calcarine sulcus：距状沟
⑤ Posterior horn（Occipital）：后角（枕角）
第三脑室：位于间脑中央，为左右间脑之间的矢状窄隙，它的前方借室间孔与侧脑室相通，后方与第四脑室相通。
第四脑室：
-
前界（底）：中脑、脑桥、延髓
-
外侧界：上，中，下小脑脚
-
上界（顶）：上髓帆，小脑小舌，尖顶
-
下界（顶）：脉络丛，脉络膜组织，下髓帆，小脑蚓垂和小结
脑脊液产生和吸收：脑脊液充满脑室和蛛网膜下隙，成人约100~140ml。脑脊液由侧脑室、第三脑室和第四脑室的脉络丛产生，保护脑和脊髓，维持颅内压，参与脑和脊髓的代谢。经脑（脊髓）蛛网膜和软脑（脊）膜间的蛛网膜下腔循环，由位于上矢状窦和颅内静脉窦及脊神经根周围的蛛网膜绒毛重吸收。
中英对照：
① Arachnoid villus：蛛网膜颗粒
② Brain：大脑
③ Lateral ventricle：侧脑室
④ Third ventricle：三脑室
⑤ Cerebral aqueduct：中脑导水管
⑥ Fourth ventricle：四脑室
⑦ Subarachnoid space：蛛网膜下腔
⑧ Superior sagittal sinus：上矢状窦
⑨ Choroid plexus：脉络丛
⑩ Straight sinus：直窦
⑪ Transverse sinus：横窦
⑫ Petrosal sinus：岩下窦
⑬ Sigmoid sinus：乙状窦
⑭ Central canal：中央管
⑮ Spinal cord：脊髓
循环途径：左、右侧脑室脉络丛→经室间孔→第三脑室→经中脑导水管→第四脑室→经正中孔、外侧孔→蛛网膜下隙→蛛网膜粒→上矢状窦→窦汇→左右横窦→左右乙状窦→颈内静脉。
内镜辅助脑室血肿清除术
作者：霍贵通 邢台市第九医院
审校：曹玉福 鹤岗市人民医院
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病例简介：男性，40岁，突发意识不清1小时入院。既往高血压病史，阿司匹林服用史。查体：血压160/100mmHg，中度昏迷，双眼右侧凝视，瞳孔正常大小，光反应迟钝，疼痛刺激肢体过伸，病理征阳性。入院1小时内手术。经额入路，3㎝骨瓣，球囊扩张置入直径0.8㎝套筒到达脑室血肿，内镜照明，吸引器吸出血肿，并单极电凝吸引器止血。手术时间1小时。术后带气管插管，镇静，术后第二天清醒，术后3天去除脑室引流管。术后1周痊愈出院，无神经系统功能障碍。
术前CT
根据3DSlicer计算穿刺角度，十字激光辅助定位。
切口及穿刺方向
管状牵开器及扩张球囊（深圳擎源）
套筒尖端直径0.8㎝，长6㎝（略短，长9cm可能更好）
内镜下操作(清除血肿和止血)
放置引流管和冲洗
缝合硬膜
骨瓣复位及固定
皮内缝合头皮切口
术后第一天CT
内镜下清除血肿
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内镜辅助脑室血肿清除术
3D Slicer在肾肿瘤中的应用
作者：赵伟 聊城市人民医院泌尿外科
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前言
对于一名泌尿外科医生，常需要将患者的影像资料进行三维重建，这不仅可以更形象、更直观的了解病变的解剖关系、结石位置，而且还可用于术前的手术规划、术前与患者谈话等。
可不可以不借助CT工作站，在自己的电脑上对影像进行三维重建呢？答案是肯定的，这就是3D Slicer软件，我第一次接触是在2013年，苦于当时全英文的界面、复杂的操作，没有继续学习。近期再次关注3DSlicer，惊喜的发现在我国神经外科领域已经被广泛关注，并开展了丰富的临床应用，而且推出了中文版（3DSlicer中国社区：www.slicercn.com）。
现将我的一点学习心得分享给大家，抛砖引玉，希望共同推进3DSlicer在泌尿外科的应用。
3DSlicer概述
3DSlicer是免费、开源的三维可视化医学图像处理、信息分析软件，由美国国立卫生研究院和全球开发者社区支持研发，至今已有10余年历史，而且还在不断更新中。最新版本引入了近1,000项增强功能和错误修复，以获得更好的性能和稳定性。 它包括百余个模块用于处理从头到脚的各种医学图像，不仅可以处理CT、MRI、DSA、PET，超声等图像，还可以处理带有时间轴信息的4D影像。
软件可以从官网（www.slicer.org）免费下载，支持64位Windows、Linux、Mac OS等系统，目前不支持平板及手机。3D Slicer默认安装在C盘，不要更改为中文目录，否则导致软件无法运行。软件不能读取中文目录下的文件，同时文件命名也不能包含中文。
3DSlicer安装成功后界面如下，部分功能依赖于扩展模块（插件），可以在扩展模块管理器（Extensions Manager）中进行安装。
进入扩展模块管理器中选择并安装“SegmentEditorExtraEffects”模块。
肾脏CTA数据导入
3D Slicer支持导入的数据有Dicom、nrrd、nii等，也支持jpeg、png等图像文件格式。下面我们以导入肾脏CTA的Dicom数据为例进行讲解。
将包含CTA数据的文件夹拖入到软件界面，弹出窗口选择默认设置，直接点击“OK”。示例为左肾肿瘤的CTA数据，伴有下腔静脉发育异常、下腔静脉与腹主动脉在肾门水平转位。
数据导入成功后，点击软件左上角的“DCM”图标，在弹出的窗口中选中相应患者，多组数据中单击选择动脉期薄层扫描数据（0.625mm），之后点击载入（Load）按钮。
数据导入成功后可在切片视窗中见到水平位、矢状位和冠状位图像，需要说明的是导入的是水平位图像，矢状位及冠状位图像是由软件自动重建的。
获取肾脏数据（Volume）
目的：从导入的CT中分割我们感兴趣的部位，以方便后面的三维重建。这里我们想要获取肾脏、肿瘤及血管等数据，可应用的方法很多，各有优缺点，有时需要联合几种方法，具体方法请关注公众号SlicerCN。下面以其中一种比较简单、通用的方法进行说明。首先进入“Segment Editor”模块。
视窗界面选取红色切片视图（Red slicer only），水平位、矢状位、冠状位分别以Red、Yellow、Green表示。
选取合适大小的球形笔刷工具，对肾脏及肾脏血管进行描绘操作，可配合橡皮擦工具擦除多余的染色。此步需要花费一点时间，但无需精确的把兴趣区域标注。
利用Mask Volume工具，选取Fill Outside选项，重建肾脏及血管Volume。
用剪刀工具剪除多余的组织。此步骤对电脑配置要求比较高，且容易出现假死机。最新4.9.0版本的3DSlicer软件对此算法进行了优化，加快了处理速度。
如下图所示为进行分割操作后的肾脏及血管。
点击左上角的Save图标，保存生成的肾脏Volume为Volume.nrrd文件。为了加快运算速度，先关闭场景，快捷键为Ctrl+W。
将Volume.nrrd拖入到软件界面或者通过Data菜单载入，进入到Volume Rendering模块中，按下图步骤操作。
选中不同的预设，调节Shift滑块可以显示不同特征及透明度的图像。
标注不同组织
点选关闭“VolumeRendering”模块中的眼睛图标，取消3D视窗的VR显示。在Segment Editor模块中利用阈值法，选取“红色”对血管进行建模操作。
点击Add增加“蓝色”，用笔刷工具标记静脉，选项可编辑区域设置为“Outside all segments”。
依次增加用于描绘感兴趣组织的颜色，并用笔刷工具逐一对肾脏、肿瘤等进行描绘。
生成并设置三维图像
点击“Show 3D”按钮，即可在3D视窗中生成三维图像，点击“Segmentations”进入分割模块可对三维图像进行各种设置。
设置三维图像是否显示及调节透明度，同时可在三维视窗中对生成的图像进行旋转，缩放等操作。
生成三维图像
生成的三维图像可以在Annotation Screenshot中进行保存。
分割之后的数据在VR中显示
可以进行标记，制作PPT，用于教学或与家属谈话等。
还可以录制成动画
动画请关注微信公众号：SlicerCN查看，文末附二维码。
展望
随着3D打印、虚拟现实（VR）、增强现实（AR）及机器人等技术的快速发展，基于医学影像的术前规划、术前虚拟演练，影像引导治疗(Image-Guidedtherapy， IGT)与外科手术导航(Image-Guidedsurgery，IGS)相结合，已逐渐成为外科发展趋势，术前对医学影像的处理如三维重建，是必备的一个步骤。
以上对肾脏、肾血管、肾上腺及肿瘤的三维重建，只是3D Slicer软件在泌尿外科非常简单的应用，希望对3D Slice软件感兴趣的泌尿外科同道相互交流，共同促进3DSlice在泌尿外科的应用。
作者微信号：sxfyzh
致谢
编辑校对
束旭俊：解放军第82医院 神经外科
曹玉福：鹤岗市人民医院 神经外科
学习交流
3DSlicer中国社区目前为国内最大的3DSlicer学习平台，学习人员以神经外科、泌尿、呼吸、心内、消化、神内、影像、放射等医生为主，也有工程师、生物医学、数学、计算机、虚拟现实、VR等相关专业人员关注。文章中所述的操作步骤的详细教程可以参照3DSlicer社区微信公众号和3DSlicer中国社区、3DSlicer中文论坛网站的相关文章。
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