3DSlicer入门解惑篇——你想知道的都在这里

欲成神功,先挥刀自宫!哦!No~

大家好,群里人数越来越多,好多小伙伴已经掌握软件基本操作,但有还有一部分小伙伴没有行动,也许还处于“迷惑+蒙圈儿”状态,还在思考:群里的老师们都用啥干了啥?该从哪儿入手呢?软件能安iPhone6 Plus上嘛?能安iPad或平板电脑上嘛?(以下图片来自网络)

3DSlicer入门解惑篇——你想知道的都在这里

借端午假期之闲,写一篇解惑软文,希望在博君一乐的同时,也有助于大家尽快上手Slicer软件。

首先给大家介绍一下我们的主角——3DSlicer软件,维基网是这样介绍滴:

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翻译过来大概是这样滴:3D Slicer是(1)一个软件平台,用以图像分析(包括配准和实时编辑),图像可视化以及图像引导治疗;(2)是一个免费、开源软件,并适用于Linux、MacOSX和windows操作系统;(3)拥有强大的可扩展性,可以通过模块嵌入方式来增加新的功能和应用。3D slicer的主要特征有:(1)适用于从头到脚的各个组织器官;(2)兼容MRI、CT、US(超声)、核医学以及显微镜下的影像;(3)拥有双向可交互性。

艾玛~,这解释有点儿晦涩难懂啊!

好~,我们说人话:Slicer可以把我们常见的CT、MRI等二维影像资料,变成下面这样(图片来自3D Slicer官网):

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当然Slicer的功能远不止以上这些,还有更强大的数据分析和图像处理功能。Slicer虽没有使用限制,但因没有通过美国FDA的认证,所以目前只提倡研究性使用,而不主张临床应用。

如果在PubMed中搜索3D slicer相关的文章,你会发现真相是这样的:

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对于我们广大临床一线医生来说,就算不写SCI,那怕用Slicer看一下三维解剖,也是有价值的。好啦!3D Slicer软件就介绍到这里,如果你想进一步了解,请访问这个网站:https://www.slicer.org/。

下面开始解答几个常见的问题:

第一个问题来了:我要到哪里下载Slicer软件?

去官网就可以下,完全免费并且绿色无污染。为了让各位看官少点击一下鼠标,我把下载地址也附上:http://download.slicer.org/。请注意根据自己电脑系统选择相应的版本下载,上一排是稳定版,下一排是开发者版本。第一列是Windows系统;第二列是苹果电脑系统;第三列是Linux系统,请不要下载错。对了,目前还没有iPhone、iPad以及Android版本。

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如果你用的是Windows系统,在下载之前,请先hold住一哈!有个问题你得先明确一下:你的电脑符不符合安装要求?目前的版本只适合64位操作系统,所以使用XP、Win7、Win8、Vista、Win10系统的小伙伴们,请看一下自己的系统是不是64位。不知道如何看系统版本的,请自行问“度娘”。

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3D Slicer对电脑硬件是有一定要求的,如果是个上网本,内存小于1G,或N年以前的配置,那么软件安装可能没问题,但要想运行顺畅嘛,就有点老牛拉破车,老汉推车的力不从心了(具体情景请自己脑补)。毕竟人家Slicer也是三维图像的软件,和3DMAX等三维制图软件比,对电脑硬件的要求算是很亲民了。

第二个问题来了:我下载了软件,如何安装呢?需要注意哪些问题?

以Windows系统安装为例,双击.exe安装文件,选择安装路径时要注意不能有中文。重要的事说三遍:安装路径不能有中文!安装路径不能有中文!安装路径不能有中文!

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第三个问题:我的电脑配置可以,有独立显卡,Slicer安装好后,双击打开Slicer怎么这么慢或卡呢?

笔记本电脑带有独立显卡的小伙伴,在你打开Slicer时,请用鼠标右键点击Slicer图标,选择以“高性能图形处理器”运行。一般情况下,电脑默认是CUP的核显运行,那当然慢咯~

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最后一个问题:以上我都搞定了!有没有速成大法,让我分分钟搞定三维成像,到底有?还是没有啊~?

有! 这个可以有~!!!

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

各位,请看秘籍~

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不必紧张!!!

不需要挥刀自宫!!!

需要的是患者的影像数据和三步操作,对~你没看错,就三步。为了给各位看官提供方便,我们附上一份CTA数据(为了便于大家下载,已转化成.nrrd格式)以便您速成神功。方法掌握后,你可以去影像科拷贝你自己患者的影像数据,具体数据的处理可以参考曹主任的教程。

CTA数据百度网盘链接:

http://pan.baidu.com/s/1dFlDlzN 密码: n6yy

第一步:打开slicer;将我们提供的CTA数据放在桌面,桌面、桌面。然后直接将CTA数据拽进slicer(载入数据我都是用拽的),再点击ok确认,你就应该可以看到图像了。

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第二步:打开Volume Rendering模块。

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第三步:加载CTA数据,点开“眼睛”,三维重建完成,大功告成。

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剩下的就是“吾将上下而求索”了,可以试着左右调一下Shift和打开下面的“眼睛”看看,会有惊喜的~

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看到这儿,是不是有种“秘籍在手,天下我有”的感觉了?(以下图片来自网络,请无视恶搞)

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万事开头难,如果你会以上这三步操作了,不仅增加了学习软件的信心,也可以协助于临床工作了,可以看颅骨解剖了,可以看颅内血管了,可以术前计划了,可以拿三维图像和患者及其家属解释病情了……

成文仓促,文章存在逻辑不严、词不达意、文笔不畅等问题,但我已尽力使之不味同嚼蜡,谬误之处还请大家多多包涵!

感谢曹玉福主任对此文的编辑,感谢彭逸龙指出文中错误之处。

最后,祝大家端午节安康!

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Volume Rendering
【网络释义】体绘制;容积再现;立体渲染