3D Slicer教程已经简介了阈值法、3D画笔法、3D魔杖法、快速推进法血肿建模的步骤,此次简略介绍Robust Statistics Segmenter(稳健统计法分割)进行血肿建模操作,数据加载及建模过程将略去,具体参见教程004及视频,文末有下载链接。本系列教程的初衷主要想起到一个抛砖引玉的作用,希望对大家有所启发。再次重申,3D Slicer目前只作为科学研究,因学习本教程应用于临床所导致的一切后果与本教程编辑人员无关,属于个人行为,后果自负。
05Robust Statistics Segmenter(稳健统计法)
首先绘制种子,选择轴位、冠状位、矢状位中一种位置即可,对血肿中心区域进行染色,可以应用的工具有PaintEffect、DrawEffect、LevelTracingEffect等,应用PaintEffect、DrawEffect时最好限定阈值范围。
首先以DrawEffect工具为例进行介绍,先限定阈值范围为45-110。
这里选择矢状位,对血肿区域进行染色,可以选择一个或多个层面,这里选择左、中、右三个层面进行染色,鼠标左键按住沿着血肿边缘进行勾勒至线条闭合后松开左键。下图是为了便于理解将三个图像调整为矢状位不同层面,实际操作过程中可以通过滑块或鼠标滚轮改变层面即可操作。
鼠标右键单击线条内部血肿区域即可自动完成限定阈值范围内染色,如有多余染色可用橡皮工具擦除,画线条时尽量接近血肿边缘会减少多余染色。
打开Roubust Statistics Segmenter模块界面进行如下设置。
运行之后可见血肿染色完全,如染色不足,可将估算体积値增大,反之减少,建模过程参照前述。如果电脑配置较低的话,运行时间要调大,特别是全脑进行染色时需要时间更长,否则会出现染色不全的情况。染色不全的另外一种情况就是边界平滑度设置的偏小。
以LevelTracingEffect工具为例进行介绍,LevelTracingEffect是灰阶追踪的意思,也可以简单理解为灰阶套索【1】,或者干脆就叫套索容易记忆。
建模过程省略,具体可参照教程004,文末有链接,。
此模块对电脑的硬件配置要求较高,运行时间偏长,但对于体积不大的组织建模有优势,尤其用于后组颅神经重建时【2】。其他方法建模将在以后教程中进行更新,未完待续。本教程视频下载百度云链接(内含脑组织建模的视频,需要说明的是此方法脑组织建模需要时间偏长,电脑容易出现假死机现象,有更简洁的方法行脑组织建模,后续教程会提到)
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