模块名称:
模块说明
- SwissSkullStripper模块为扩展模块,需要在扩展模块管理器中进行下载。
- 多用于MRI数据的颅骨自动剥离
- 剥离前需要加载2个文件,分别为atlasMask.mha、atlasImage.mha.
- 用户可以在示例数据模块下载网站的文件atlasImage、atlasMask.mha.
点击下面链接也可以进行下载。
atlasImage.mha (3.4 MB)
atlasMask.mha (56.5 KB)
用法
- 加载 AtlasImage 和 AtlasMask 图像。
- 并确保已选中“AtlasMask”卷标的“ Labelmap” 复选框** 。
- 加载患者容积数据,也就是我们要进行剥离颅骨操作的容积数据。
- 转到 SwissSkullStripper 模块进行如下操作。
Input(输入)
Patient Volume (患者容积数据 ):选择要进行颅骨剥离的容积数据。
Output(输出)
Patient Output Volume(病人输出容积数据):给剥离颅骨后的数据起个名字。
Patient Mask Label(病人蒙版标签数据):新建一个标签数据。
Atlas
Atlas Volume :选中载入的 atlasImage
Atlas Mask Volume :选中载入的 AtlasMask ,如果不可见,则在导入数据的时候,要勾选Show Options后,将Labelmap复选框勾选上。
单击Apply,在大约2分钟内MRI的颅骨就自动剥离完成,同时产生一个大脑的标签。
剥离后的效果图
CT的剥离效果支持却不是太好,原因是提供的数据只支持MRI。
重新制作CT的Mask用于此模块,对CTA数据进行剥离的效果如下:
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