3D Slicer教程(002)数据导入

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【教程002】数据导入(一)

3D Slicer 教程(001已经介绍了软件的安装及设置,要求安装及设置界面的所有文件目录名都不能为中文名称,再次重要提示!导入的数据不能存放在中文文件目录里。不同厂家Dicom文件的执行标准不一致,导致同样是Dicom格式有的可以导入到3D Slicer中应用,有的不可以,需要借助其他软件。尤其DTI的数据导入因MRI品牌的不同,甚至同一厂家不同型号的机器导入方法也不一致,在此不展开讲解,后续教程进行补充。

01本地数据库目录设置

默认本地数据库存放在系统盘用户名下,一般情况下不用改动,如果导入数据出错时需要查看是否包含中文名目录,目录也可以更改为其它位置,并不局限于系统盘。

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02数据输入(Import)

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03文件保存(Save)

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如果想加载文件就出现上图所示界面的话,需要保存成*.mrb格式或者存盘时*.mrml、*.nrrd、*.vtk等文件同时保存。

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如果只存盘Slicer或Model文件,则仅保存支持文件格式即可。

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04文件导入(Add Data)

 

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导入场景时需要多文件同时导入或者直接导入*.mrb文件。

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打开界面时会出现3D场景

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如果只是导入*.nrrd或*.nii.gz等格式时并不会出现3D场景。

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05其它方式导入

如果以上导入方法失败的话,可以借助以前的版本(如3.6.0、4.1.1等版本)或其他软件先将文件转换成*.nrrd、*.nii.gz、*.hdr、*.dcm等格式,再由3D Slicer导入数据。

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应用Mango软件进行数据转换,具体转换方法请关注本公众号,回复“Mango”,可获知导入方法。

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其他可用的数据转换软件还有很多,这里不逐一介绍。

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致谢:应用3D Slicer 4.1.1版本将数据转换成nrrd格式方法由宁夏医科大学霍显浩提供。

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3D Slicer系列教程

001 软件安装及设置:

http://mp.weixin.qq.com/s/yiXpKZh_hx2IUk2IAYXTag

更多教程请关注公众号:鹤岗市神经外科HGsjwk

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