3DSlicer定位零基础05-数据导入

作者:曹玉福

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 脑出血定位贴定位零基础 05 

3DSlicer数据可以直接导入到3DSlicer中,也可以应用Mango、dcm2niigui、医三维等软件转换后,再导入到3DSlicer中应用。优缺点各不相同,选择最适合自己的就好。

一、3DSlicer导入

1、DICM菜单导入

从CT或MRI工作站刻盘取得DICOM数据后,复制到电脑中,注意文件名称和路径不能为中文,否则会出现导入失败。点击3DSlicer的DICM菜单即可进入到导入界面。

脑出血定位贴定位零基础之数据导入

导入数据的时候,界面下方的下拉对话框需要选择Add Link或者Copy,默认为Add Link。Add Link只是加入一个链接,而Copy则是将数据复制到3DSlicer的默认保存路径:

C:UsersAdministratorDocumentsSlicerDICOMDatabase

脑出血定位贴定位零基础之数据导入

2、文件夹拖入法

将包含DICOM数据的文件夹拖入到3DSlicer界面中即可导入到默认目录中,应用时从DICM菜单中打开患者的数据即可。

脑出血定位贴定位零基础之数据导入

二、Mango转换后导入

Mango软件可以将混杂在一起的文件按照患者及序列自动进行区分。

脑出血定位贴定位零基础之数据导入

打开相应的序列后,再保存为nii.gz文件,拖入到3DSlicer软件中即可应用。

脑出血定位贴定位零基础之数据导入

三、dcm2niigui转换后导入

软件转换选择Compressed FSL(4D NifiTi nii)或者FSL(4D NifiTi nii)均可。

脑出血定位贴定位零基础之数据导入

将文件夹拖入到软件界面,很快即可完成转换,转换后的nii文件自动保存在文件夹里。将nii文件拖入到3DSlicer界面中即可完成数据导入。

脑出血定位贴定位零基础之数据导入

四、医三维转换后导入

如上述数据导入时出现下图中图像畸变的情况,可以应用医三维软件进行转换,顺便把OM线也调整了。医三维目前只有Windows版本,3DSlicer中文论坛有软件的用法及下载地址,这里不再赘述。

https://forum.slicercn.com/t/topic/242

用于练习的数据下载地址:

https://forum.slicercn.com/t/topic/1722

脑出血定位贴定位零基础之数据导入


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