DTI教程12-纤维束成像的参数调节

模块描述

(Module Description)

参数设置

(Parameters set)

Parmeters Node：参数节点

预设默认选择Slicer4 Interactive Seeding Defaults（适用于Slicer 4.0版本以上，建议应用4.8.1以上的版本进行本教程的练习）

• Parameters（参数）：选择模块的现有设置或创建一个新的设置。

• Presets（预设）：为模块选择Slicer4或Slicer3参数设置，目前版本共有3个选项。
  • Slicer4 Interactive Seeding Defaults：默认Slicer4交互种子。
  • Slicer3 Labelmap Seeding Defaults：默认Slicer3标签映射种子。
  • Slicer3 Fiducial Seeding Defaults：默认Slicer3基准点种子。

IO：IO面板

• Input DTI Volume（输入DTI数据）：选择现有的张量数据（DTI）。

• Output Fiber Bundle（输出纤维束）：默认为“FiberBundle”。

Seeding：种子

• Input Fiducials，Model or Label Map： 种子可以选用标签映射体数据、模型或者基准点列表（包含1个或多个基准点，默认用“F”表示），此处演示选取胼胝体的标签映射体数据作为种子（CC-Lable）。

• Seeding Label Value：种子标签值，默认为1。

• Seed Spacing（mm）：种子间距，表示选取种子间的距离，单位为毫米，这个功能只有在没有勾选使用索引空间复选框时才有效。下图分别为种子间距设置为0.5、1.0、1.5、2.5mm时纤维束成像情况。

。

• Use Index Space：使用索引空间，勾选后在IJK中选择体素作为种子。勾选后种子间距调节将不起作用。

• Random Grid：随机网格，勾选后能够随机放置种子点。

Update：更新

• 点击“Update”即可在三维视窗中观察纤维束成像情况，调节各参数后，需要重新点击“Update”。

纤维束参数

(Tratography Parameters)

• Threshold Type：阈值类型，Fractional Anisotropy

• Seeding Threshold：种子阈值

• Stopping Threshold：停止阈值

• Integration Step Length（mm）：积分步长，表示同一根纤维上点之间的距离，单位为毫米。

下图为调节积分步长纤维束成像的变化。

高级选项

(Advanced Options)

• Minimum Length（mm）：表示成像纤维的最小长度，仅选择大于此值的区域，单位为毫米。
• Maximum Length（mm）：表示成像纤维的最大长度，仅选择小于此值的区域，单位为毫米。
• Stopping Track Curvature：停止追踪曲率，当纤维的曲率半径小于此值时纤维追踪将会停止。
• Create Tracts Initially As：选择Tubes（管）或Lines（线）。

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