DTI教程12-纤维束成像的参数调节

【12】纤维束成像的参数调节

DTI教程12-纤维束成像的参数调节

模块描述

(Module Description)

DTI教程12-纤维束成像的参数调节

这个模块可以对感兴趣的区域进行纤维束成像,可以通过调节各参数对纤维束成像进行交互。

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参数设置

(Parameters set)

 

Parmeters Node:参数节点

预设默认选择Slicer4 Interactive Seeding Defaults(适用于Slicer 4.0版本以上,建议应用4.8.1以上的版本进行本教程的练习)

  • Parameters(参数):选择模块的现有设置或创建一个新的设置。

  • Presets(预设):为模块选择Slicer4或Slicer3参数设置,目前版本共有3个选项。
    • Slicer4 Interactive Seeding Defaults:默认Slicer4交互种子。
    • Slicer3 Labelmap Seeding Defaults:默认Slicer3标签映射种子。
    • Slicer3 Fiducial Seeding Defaults:默认Slicer3基准点种子。

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IO:IO面板

  • Input DTI Volume(输入DTI数据):选择现有的张量数据(DTI)。

  • Output Fiber Bundle(输出纤维束):默认为“FiberBundle”。


Seeding:种子

  • Input Fiducials,Model or Label Map: 种子可以选用标签映射体数据、模型或者基准点列表(包含1个或多个基准点,默认用“F”表示),此处演示选取胼胝体的标签映射体数据作为种子(CC-Lable)。


  • Seeding Label Value:种子标签值,默认为1。

  • Seed Spacing(mm):种子间距,表示选取种子间的距离,单位为毫米,这个功能只有在没有勾选使用索引空间复选框时才有效。下图分别为种子间距设置为0.5、1.0、1.5、2.5mm时纤维束成像情况。

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  • Use Index Space:使用索引空间,勾选后在IJK中选择体素作为种子。勾选后种子间距调节将不起作用。

  • Random Grid:随机网格,勾选后能够随机放置种子点。

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Update:更新

  • 点击“Update”即可在三维视窗中观察纤维束成像情况,调节各参数后,需要重新点击“Update”。

纤维束参数

(Tratography Parameters)

  • Threshold Type:阈值类型,Fractional Anisotropy

  • Seeding Threshold:种子阈值

  • Stopping Threshold:停止阈值

  • Integration Step Length(mm):积分步长,表示同一根纤维上点之间的距离,单位为毫米。

下图为调节积分步长纤维束成像的变化。

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高级选项

(Advanced Options)

  • Minimum Length(mm):表示成像纤维的最小长度,仅选择大于此值的区域,单位为毫米。
  • Maximum Length(mm):表示成像纤维的最大长度,仅选择小于此值的区域,单位为毫米。
  • Stopping Track Curvature:停止追踪曲率,当纤维的曲率半径小于此值时纤维追踪将会停止。
  • Create Tracts Initially As:选择Tubes(管)或Lines(线)。

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     作 者     
  • 曹玉福:鹤岗市人民医院神经外科

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文章链接:

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DTI