DTI教程11-胼胝体纤维束成像

【11】胼胝体纤维束成像

DTI教程11-胼胝体纤维束成像

模块描述

(Module Description)

DTI教程11-胼胝体纤维束成像

利用此模块可以对感兴趣的区域进行纤维束成像,可以在FA图中定义感兴趣区域(ROI),以胼胝体纤维束成像进行讲解。

胼胝体标签图

(Corpus Callosum Lable map)

1、在切片视窗控制界面将前景层选为DTI,透明度系数设置为0.40。背景层选为FA,其叠加后效果如下图所示。

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2、进入到Editor模块,主体数据选取FA,融合体数据自动命名为FA-label。

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3、利用绘画工具对胼胝体进行描绘。

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4、按照上面方法对胼胝体至少描绘3~5个层面。

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参数设置

(Parameters set)

Parmeters Node:参数节点

  • Parameters(参数):选择模块的现有设置或创建一个新的设置。
  • Presets(预设):为模块选择Slicer4或Slicer3参数设置,目前版本共有3个选项。
    • Slicer4 Interactive Seeding Defaults:默认Slicer4交互种子。
    • Slicer3 Labelmap Seeding Defaults:默认Slicer3标签映射种子。
    • Slicer3 Fiducial Seeding Defaults:默认Slicer3基准点种子。

IO:IO面板

  • Input DTI Volume(输入DTI数据):选择现有的张量数据(DTI)。
  • Output Fiber Bundle(输出纤维束):默认为“FiberBundle”,示例选择“Create new FiberBundle as…”并命名为“FB-Brain”

Seeding:种子

  • Input Fiducials,Model or Label Map:选择一个现有的基准点列表、模型或标签映射体数据作为跟踪的种子。
  • Seeding Label Value:种子标签值,默认为1。
  • Seed Spacing(mm):种子间距,表示选取种子间的距离,单位为毫米,这个功能只有在没有勾选使用索引空间复选框时才有效。
  • Use Index Space:使用索引空间,勾选后在IJK中选择体素作为种子。
  • Random Grid:随机网格,勾选后能够随机放置种子点。

Update:更新

  • 点击“Update”即可在三维视窗中观察纤维束成像情况,调节各参数后,需要重新点击“Update”。

胼胝体纤维束成像

(Corpus Callosum Fiber Bundle)

参数设置如下,其他参数为默认。

  • Presets:预设默认为 Slicer4 Interactive Seeding Defaults

  • Input DTI Volume:选择张量数据DTI

  • Output Fiber Bundle:选择“Create new FiberBundle as…”并命名为“FB-CC”

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参数调节

(Parameters Adjustment)

Seed Spacing:种子间距表示选取种子间的距离,单位为mm,这个功能只有在没有勾选Use Index Space(使用索引空间)复选框时才有效。

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     作 者     
  • 曹玉福:鹤岗市人民医院神经外科

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文章链接:

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2、DTI教程02-数据转换初阶

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7、DTI教程07-计算弥散张量

8、DTI教程08-Fa图及标量测量

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10、DTI教程10-大脑纤维束成像

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