DTI教程06-大脑掩模（Brain Mask）

【06】大脑掩模（Brain Mask）

从弥散加权图像创建一个大脑掩模（Mask），为方便交流，后续文章Mask将不做翻译。Mask可用于计算弥散张量或用于纤维束成像的种子。大脑Mask通过平均所有基准图像 (非弥散加权图像) 计算，应用Otsu阈值算法分割组织体素，然后去除小的不连通区域。

Mask应用场景：

1、从弥散加权图像（DWI）创建大脑Mask，FA图设定在Mask包含的范围之内，通过去除Mask之外的噪声数据，从而使FA图看起来更美观。

2、使大脑Mask作为种子进行脑的纤维束成像。

IO（输入输出参数设置）：

Input DWI Volume：输入DWI数据。

Output Baseline Volume：输出基准数据（b0图像）。

Output Diffusion Brain Mask：输出大脑Mask。

Mask settings（mask设置）：

Baseline B-Value Threshold Parameter：基准b值阈值设置参数。

Remove Islands in Brain Mask：除去大脑Mask中小的未连接区域。

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