【04】DTI数据转换高阶
常见错误
(Common error)
转换过程中比较常见的错误为缺少b值和梯度方向参数而出错，尤其在转换Siemens数据的时候。有时并非真正的缺少相应的参数，而是转换模块没有正确读取，这时候我们需要应用到另外一个软件MRICron。
另一个转换软件
(MRICron)
MRICron为医学图像查看器，适用于Windows、Linux 和OSX操作系统。软件包含用于转换DICOM图像的转换程序dcm2nii和dcm2niigui，dcm2nii为命令行程序，dcm2niigui是图形用户界面，我们要用到这个小程序。
程序界面如下：转换选项有下列几个，选用FSL（4D NIFTI nii）或Compressed FSL（4D NIFTI nii）均可，前一个转换后扩展名为.nii，后一个转换后为压缩格式，扩展名为.nii.gz。
软件用法
(Conversion method)
只需将数据文件夹拖放到软件界面即可自动转换，转换后查看下级目录，应该至少有三个文件，分别为转换后主数据文件（.nii.gz）、b值数据文件（.bval）和梯度信息文件（.bvec）。
转换后的.bval和.bvec文件可以用记事本或写字板打开查看相应信息。
转换方法
(Conversion method)
转换选项选择FSLToNrrd，Output DWI Volume file填写为DWI，NiftiFSL To Nrrd Conversion Parameters（转换参数）选填为转换好的相应文件，点击Apply即可完成转换。
更多转换问题可在论坛发帖提问，必要时需要提供所有原始数据。论坛网址参见文末。
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曹玉福：鹤岗市人民医院神经外科
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