DTI教程03-数据转换中阶

【03】DTI数据转换中阶

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查看转换状态

(Status)

当转换结束的时候,会在状态处显示为 Status:Completed,提示转换完成,同时在切片视窗中显示转换成功的DWI图像。

如果状态处显示为 Status:Completed with errors,则要查看错误提示,如下图将提示错误的文本拷贝下来,发帖到论坛求助即可,必要时需要提供全部原始数据才能分析出错原因。

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合并文件后转换成功

(Siemens Data 1346)

此例提示缺少切片数量,不止1000个DICOM文件(每个文件大小均为136K)。通过查看另外一个文件夹,发现还有364个文件均为136K,将两个文件夹内的文件合并到一个文件夹中,再次进行转换成功。

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混杂数据

(Different volume in one directory)

同一目录中有多个序列,可根据文件名称及文件大小进行区分。

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利用Mango软件非常容易区分序列,Mango软件下载地址:

http://rii.uthscsa.edu/mango//mango.html

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载入DICOM文件夹后,软件自动区分序列如下图,第一列为序列的名称,第二列为图像尺寸,第三列为每个序列的切片数量。其中ep2d_diff_mddw_20_p2为要转换的DWI序列,点击Open打开。

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切片视窗中可见一共有72帧(代表有72个梯度方向)DWI文件,拉动滑块可以查看其它帧的图像,点击File菜单中Show File。

 

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软件会自动定位到相应文件所在的文件夹,并高亮显示文件。

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定位的文件均为894K左右的文件,一共72个,拷贝到单独的文件夹中,即可成功进行转换。

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DICOM文件浏览器

(Dicom file browser)

上述方法还是比较麻烦,数据不是太复杂的情况下,可以应用XnConvert软件对DICOM文件进行预览,如发现下图所示即为需要进行转换的文件。

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XnConvert是一个功能强大的图像转换批处理软件,官方介绍兼容500种格式,也适用于DICOM文件与Png、Jpg等格式进行相互转换。如将上图中的一个DICOM文件转换成Png格式文件如下图所示,可见每帧由25个切片组成。

软件下载地址:

http://www.xnconvert.com

 

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使用XnConvert软件的目的是找到哪些是需要进行转换的DWI数据,千万别将DICOM文件转换成图片格式,否则将无法用于重建。

将找到的72个DICOM文件拷贝到单独的一个文件夹中,即可进行转换了。

不是所有需要转换的数据都显示成72帧×25个切片,与机器的品牌有关,有些机器就是显示为下图中图像。

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     作 者     
  • 曹玉福:鹤岗市人民医院神经外科

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文章链接:

1、DTI教程01-DTI简介及软件安装

2、DTI教程02-数据转换初阶