3D Slicer无法导入刻录光盘内的影像图片问题

济南军区总医院神经外科 王奎重

        利用3D Slicer进行图像三维重建或DTI纤维束重建等过程中，有人第一步就卡壳了，拿着CT或MRI机器刻录好的原始数据光盘却无法导入影像数据。有人会抱怨机器刻录的光盘不行，可在原来的机器上还是能正常读取它自己刻录的光盘数据。除了坛子里介绍的3D Slicer本身的设置问题外（如导入路径中不能出现中文字符等问题），常见问题就是通常大家所说的不同厂家影像工作站刻录的数据格式“不兼容”。有的图片在PACS系统传输过程中为了增加传输速度进行了压缩，有的不是标准的DICOM格式图片。比较常见的有.img格式的图片，也有raw等格式，甚至有的影像图片连后缀名也没有。

这些不同格式图片可以用刻录光盘的自带浏览器阅读，但一般这些自带的浏览器读取图片速度慢，后处理功能少，大多数仅能保存JPG格式的图片。这里介绍利用efilm第三方软件把光盘内的原始图片转化为标准的DICOM格式，可供3D Slicer读取导入。

1.官网上下载efilm workstation软件，安装完毕后一定期限内免费使用，efilm2版本只能在XP系统上安装，efilm3以上版本可以在vista及win7、8、10系统上安装。打开软件，弹出搜索对话框。依次点击①光盘图标→②path按钮→③desktop文件夹。点击desktop的＋号，找到我的电脑→光盘（G盘）→目录文件，一般名称为DICOMDIR，选中该文件。点击④search，即可找到光盘中的患者信息。

2.点击view按钮可看到图片。要想把图片保存为DICOM格式，鼠标点击该图片，可见图片周围变成绿色虚线框，点击①Im，可见该序列所有图片右下角均出现②黄色小方块，点击file→③save as进行保存。如果不点击①Im而直接点击图片右下角，出现黄色小方块，此时只选中了该张图片而不是整个序列的所有图片，再点击右下角黄色方框，则该黄色框消失，说明该图片未选中。

3.弹出保存对话框，找到合适的储存文件夹，新建一个文件名，点击保存，即可保存为DICOM格式图片。可以利用3D slicer软件导入这些图片了。

4.下面介绍如何利用efilm转化出DICOM格式图片让3D slicer读取，为DTI做准备。首先利用efilm导入完整的DWI序列图片，依次点击file import→dicom image（s）→desktop→my computer→disk（G:），即可导入光盘目录下所有DICOM格式图片到本机磁盘上。在search对话框的本机磁盘上寻找到该患者，在搜索对话框内依次点击local exams→患者→burn to media。

5.在弹出的刻录对话框中，package title下输入一个名字，点击该患者左侧＋号，可以看到很多序列，其它无用序列统统删除（点击remove按钮），仅保留需要的DWI序列（有的序列名字以DTI开头，如DTI 50 directions）。注意选中DICOMDIR-IHE Compliant选项，第二个选项为压缩文件，3D slicer无法进行弥散张量转化，下面的方框选项为刻录时自带浏览器，没必要选中。再选择create pachage but do not burn按钮，仅建立数据包不是真正刻录，点击continue弹出对话框把数据保存在合适的文件夹中（一般在efilm安装根目录下的CD文件夹中）供3D slicer转化，具体转化过程曹玉福主任介绍的非常详细。

根据笔者的经验，以上方法建立的数据包内同一序列的图片都在一个文件夹内，且文件大小一致。而选择上一步骤中maintain compression where prsent选项所建立的数据包，把DTI序列的数据压缩后图片文件大小不一，3D slicer无法进行不同方向的DTI转化，只能进行普通向量图片转化（如b0状态下的DWI图像）。

注：本文仅供个人学习交流，不妥之处恳请大家批评指正。未经本人同意不得擅自转载及他用，有关参照本文产生的纠纷及法律后果本人概不负责。