3DSlicer畸变图像校准之医三维方案

罗俊杰 十堰市人民医院神经外科

3DSlicer社区微信公众号中有文章介绍过应用3DSlicer对畸变图像进行校准的方法。我个人常用另一种更直观的方法进行校准，应用到国产软件医三维和国外的一个影像处理软件Mango。 

CT扫描时为了获得标准的OM基线时，技师会通过调整扫描机架与扫描床的角度来完成。 

相关倾斜角度信息可以在CT胶片中进行查看，如下图CT图像所示倾斜度为-12.0。

将这样的数据直接导入3D Slicer软件中，会产生图像畸变。

1、启动医三维软件：选中相应数据文件夹并导入影像数据，在软件界面下栏中鼠标右键点击图标，选择MPR重建并在新标签中打开。 

2、标准OM基线调整：通过调节弧形箭头简单几步即可完成。

3、切片重组：如下图选中右上角绿色图标，在弹出对话框中对序列描述进行重命名，方便记忆但不能为中文。步长（mm）为层距，Slicer count为Slicer数量，为系统自动生成，不需更改。

4、数据储存：转换后的数据文件储存的默认目录在C盘用户文件夹里，可以在软件设置中对工作空间路径进行更改。

5、数据导入：将数据导入到3D Slicer中，发现畸变并没有得到校准。

6、数据转换：应用国外的影像处理软件Mango对数据进行转换后才能用于3D Slicer，将文件导入到Mango中，另存为nii.gz（压缩格式）或者nii格式。

7、数据导入到3DSlicer：将Mango转换后的nii格式文件导入到3D Slicer中，发现畸变已经得到校准。

应用医三维和Mango这两个小软件可以方便直观的调整OM线和校准畸变。软件小巧、占用系统资源少、运行流畅，医三维软件还有体重建、数据测量、一键去除背板、一键去除颅骨等功能，值得一试。

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