3D Slicer与Mimics坐标统一问题（高级版）

3D Slicer与Mimics坐标统一问题（高级版）
济南军区总医院神经外科 王奎重

前面介绍了利用Mimics重建出的STL格式的3D模型再经过Mimics坐标转化后导入3D Slicer可以与原始图像完美融合。本文介绍通过3D Slicer强大的坐标转换功能，同样可以达到两款软件重建图像的完美重叠。

1.打开Mimics软件，点击options-references,进入设置界面。

2.在弹出设置对话框选择visualization，可见下面coordinate systerm默认是word coordinate systerm，需要更改为第一个坐标系。

3.选择STL coordinate system，并依次点击apply，OK。

4.此时Mimics软件的坐标系已经设置好，导入患者的原始图像即可对兴趣区域进行重建，并以STL格式输出保存。

5.打开3D Slicer，导入患者的原始DICOM格式图像（勿用mango处理过的图像）和刚才Mimics重建的3D图像，可见两个图像不能匹配。

6.点击transforms模块，新建一个坐标系，把3D图像移入右侧框内，修改图中红色框内矩阵数值均为-1.00，可以看到两者图像匹配了。

7.当然，不用修改矩阵数据，修改红框内IS进度条使3D模型沿轴位方向旋转180°也能达到同样效果，此时可以看到转换矩阵transform matrix两个数值自动变为-1。

8.最后选择3D模型，点击固定转换harden transform按钮，把3D模型自动进入左侧框内，保存图像即可。

9.同理，也可以把3D Slicer生成的3D模型经过上述方法转换后保存为STL格式，导入Mimics中，与Mimics中的图像完美融合，具体方法不再赘述。

不同软件因为重建图像时选择的坐标系不同导致同一个病人的数据重建出的图像不能相互融合，本文通过修改矩阵方法较好的解决了这一难题，具体原理参照有关教材和文献。

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