导言
之前写了几个去除背板的教程,主要应用到Volume clip with model模块。今天的教程主要应用到Segment Editor模块中的Mask volume工具,两者有异曲同工之处。
01. 导入数据如下图。
02. 进入Segment Editor模块:① 点击Add增加一种颜色;② 选中Threshold(阈值工具);③ 阈值下限填写-100(根据输入数据情况进行调节),上限不变,或者调解滑块使颅脑部分染色完全;④ 点击Apply运行。
03. 在二维视窗中可见颅脑部分染色完全。
04. 在3D视窗中用剪刀工具去除背板及其他不需要的部分,可以直接在视窗中进行操作,因为实时运算对电脑的配置要求较高。
05. 如果电脑配置不高,可以进行如下操作进行,缺点是没有剪刀剪切的直观,而且背板与颅脑不应有相连接的部分。① 关掉Show 3D(电脑配置高可以省略此步骤);② 选中IsIands(岛)工具;③ 选择Keep selected island(保留选中的岛)之后点击二维视窗中需要保留的颅脑部分;④ 点击Apply运行。
06. 可见背板染色去除,颅脑染色完全,可以用剪刀剪去吸氧管等不需要部分。
07. 最后一步:① 选中Mask volume工具;② 选择Fill outside(填充外面:是指对染色的颅脑之外的未染色部分进行填充);③ Fill value(填充灰度值):填写数值-1000(空气CT值)进行填充;④ 选中Input value(此数据名称为“CT”);⑤ Out Volume(输出Volume):最终得到的Volume。⑥ 点击Apply运行。
08. 如果没有Mark volume工具,需要在扩展模块中进行安装,下面几个常用的建议安装。
09. 在Volume Rendering模块中查看刚才生成的Volume,3D视窗中可以看到背板已经去除了。
附上本教程视频:
既往的去背板教程更多的是想让大家熟悉各模块和工具的使用方法,3D Slicer版本升级较快,几乎每周都有2次以上的升级,尤其Segment Editor模块中工具的更新,极大的方便了建模等操作,原来使用的方法显得繁琐,以后将逐渐更新一部分教程,请大家关注。
3D Slicer 4.80稳定版下载网页:
http://slicer.kitware.com/midas3/folder/274
去背板教程链接:
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