3DSlicer教程(014)CTA(三)

【教程014】CTA(三)

导言

3D Slicer教程之CTA已经讲解了CTA数据分析、数据提取、减影操作、影像剪切等。今天继续讲解应用模块Volume clip with model进行剪切操作。3D Slicer教程希望能起到抛砖引玉作用,对大家有所启发。再次重申,3D Slicer目前只作为科学研究,因学习本教程应用于临床所导致的一切后果与本教程编辑人员无关,属于个人行为,后果自负。CTA系列教程以GE 64128CT原始扫描数据(刻录光盘)为例,操作系统为Wondows 10、CPU i7 6700K、GPU GTX 1060 6G、内存16G、SSD 128G(并非推荐)。

05剪切操作(二)

导入数据后如下图

3DSlicer教程之CTA(三)

我们今天病例重点想关注双侧颈内动脉与床突的关系,可以应用Crop Volume模块进行剪切,但剪切范围取决于ROI调节框,无法调整角度。模块Volume clip with model(字面意思可以理解为应用modelVolume进行剪切操作)可以进行曲面的切割。通过菜单Segmentation选择Volume clip with model模块,也可在模块搜索框内输入clip模糊查询。

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下图界面Input volume为默认已经打开的文件,如果已经打开了两个以上文件则选择为当前文件。Clippingsurface(剪切面)选择Create new model或者Create new model as…(可以自行命名)Clipping surface from markups(剪切面标记点)命名规则基本相同,创建后默认为CClip outside选择对勾则剪除model之外的部分,去掉对勾则剪除model包含的部分。Fill value是剪除后填充部分的灰度值,这里选择空气的密度值(CT:-1000),output Volume选择Create new Volume,默认为Volume。设置好后先不要点击Apply

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如果想更改默认的名称,可以在模块Subject Hierarchy中右键单击菜单里选中Rename进行操作。

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选中快捷菜单栏中Fiducial(基准点)工具,Persistent(持续)之前打勾,可以连续应用基准点工具进行标记而不必每次应用都去重新点选。

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选择Red Slicer并通过滑块或鼠标中键选择颈内动脉床突层面,通过标记点确定要保留区域的大致范围。

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取消选择基准点工具后,鼠标变成手形状时可以拖动标记点位置进行调整。

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可以在模块Markups中调节标记点的显示比例、重命名、是否显示、删除、调节透明度、改变颜色、改变显示图标等操作,调节后可以储存为默认。

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更多操作可以参见教程配套视频,这里不再赘述,教程配套视频获得方法请关注3D Slicer交流群(入群可以加微信:caoyufu,加好友请注明姓名、医院、专业、3D 字样)。

通过Markups模块调整标记点为绿色,标记点重命名规则改为%N%d,重新操作后Red Slicer标记点显示如下。

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再根据冠状位和矢状位分别确定上下和左右的边界,为了便于区分,可以调整为其他颜色进行显示,冠状位或矢状位进行标记后,3D视窗会出现立体的Model显示。

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已经确定了剪切的范围,返回Volume clip with model模块,基准点选择C,剪切后填充部分灰度值选择-1000,输出Volume选择后点击Apply,剪切后Volume如下图,不满意可以重新调整标记点后重复上述步骤进行剪切操作。

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Markups模块中取消显示标记点或者全部删除标记点

图片[12]-3DSlicer教程(014)CTA(三)-临床影像实践

Models模块中点灭眼睛图标使model不显示或者删除model,进入Volume Rendering模块,预设应用CT-Coronary-Arteries-3,演示系统配置为独立显卡GTX1060 6G,故下列选项设置为RenderingVTK GPU Ray CastingGPU Memory SizeDefault 6144MB(默认6G显存)Quality Control:Maximum Quality(最佳质量),具体设置详见教程001,文末有链接。3DSlicer教程之CTA(三)

图形显示界面布局调整到3D only

3DSlicer教程之CTA(三)

多角度查看动脉瘤夹闭满意,后交通动脉保留完好。

3DSlicer教程之CTA(三)

本教程视频下载地址将发在3D Slicer交流群里。

未完待续

3DSlicer教程之CTA(三)

3D Slicer系列教程

001 软件安装及设置

002 数据导入

003 MRA实体重建

005 颅内病变体表定位

004 血肿建模(一)

006 血肿建模(二)

007 血肿建模(三)

008 血肿建模(四)

009 血肿建模(五)

010 血肿建模(六)

011 血肿建模(七)

012 血肿建模(八)

013 3DSlicer教程之CTA(一)

014 3DSlicer教程之CTA(二)

更多教程请关注公众号:鹤岗神经外科(HGsjwk)

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